「台灣養蜂協會」為全國性社團組織,會員人數自創會後逐年增加,乃依人民團體法規定,以各縣市會員人數比例產生會員代表,會員代表大會為本會最高權力機構,現今本會設有會員代表51人,由代表大會選出理事21人及監事7人,並由理事互選常務理事七人,再由常務理事中選出理事長一人及副理事長兩人處理會務。另由監事互選常務監事一人,監理本會經費等各項會務推動,所有選任人員任期均為三年。
    為辦理本會各項業務,得由理事長遴選秘書長一人及工作人員若干人,經理事會通過後聘任。甫缷任理事長,得經全體理監事同意後聘任為榮譽理事長。另得經理事會通過後聘請顧問及設立福利、財務、研究及聯絡等小組,組長及組員由理事會遴選聘任。另依第十三屆第一次理、監事聯席會決議,特設置「蜂產品標章驗證委員會」以執行「國產蜂產品證明標章」有關業務。