「台灣養蜂協會」為全國性社團組織，會員人數自創會後逐年增加，乃依人民團體法規定，以各縣市會員人數比例產生會員代表，會員代表大會為本會最高權力機構。

    現今本會設有會員代表51人，由代表大會選出理事21人及監事7人，並由理事互選常務理事七人，再由常務理事中選出理事長一人及副理事長兩人處理會務。另由監事互選常務監事一人，監理本會經費等各項會務推動，所有選任人員任期均為三年。

    為辦理本會各項業務，得由理事長遴選秘書長一人及工作人員若干人，經理事會通過後聘任。甫缷任理事長，得經全體理監事同意後聘任為榮譽理事長。另得經理事會通過後聘請顧問及設立福利、財務、研究及聯絡等小組，組長及組員由理事會遴選聘任。

    另依第十三屆第一次理、監事聯席會決議，特設置「蜂產品標章審核委員會」以執行「國產蜂產品證明標章」有關業務。